
Sora tem 14 anos no princípio de Kingdom Hearts e vive nas Destiny Islands com os seus melhores amigos Riku e Kairi, e outros, incluindo Selphie, Tidus e Wakka. Sora e os seus dois amigos mais chegados procuram ver o mundo para além das ilhas e começam a construir uma balsa. No entanto, uma estranha força obscura ataca as ilhas e Sora é arrastado da sua casa e separado dos seus amigos. Seu mundo então é atacado por Heartless e ele acaba entrando em uma fenda que liga os mundos, caindo em Traverse Town (Cidade da Travessia).
Lá ele conhece Donald Duck (Pato Donald) e Goofy (Pateta), o Mago Real da Corte e o Capitão da Guarda Real do Disney Castle, respectivamente, que partiram em missão após o desaparecimento de seu rei, Mickey Mouse (Mickey Mouse). Os três decidem procurar pelos seus amigos juntos, especialmente desde que Donald e Goofy acreditam que Sora é quem irá derrotar a força obscura pois ele possui a arma conhecida como Keyblade.
Na Traverse Town, Sora encontra Riku e descobre que nenhum deles conseguiu encontrar Kairi. Riku, vendo que Sora se tornou amigo de Donald e Goofy, pensa que Sora se esqueceu dele e de Kairi e decide encontrar Kairi sozinho. Sora acaba por cruzar vários mundos para parar os Heartless, as criaturas que encarnam a escuridão, e também resgatar as Sete Princesas de Coração, que são a chave para abrir a última fechadura que irá abrir caminho para Kingdom Hearts, o objectivo dos vilões que controlam os Heartless.
Quando se descobre que Kairi é uma das Princesas de Coração, Sora descobre que Riku acredita que o coração dela foi roubado pelos Heartless. Na verdade, o Sora tinha contido o coração de Kairi dentro dele durante todo o jogo desde que ela o atravessou no príncipio do jogo. Para entregar o coração dela, Sora usa a Keyblade obscura para retirar o seu coração e o dela, tornando-se num Heartless por um curto espaço de tempo antes de ser restaurado ao normal. Maleficient (Malévola) introduziu Riku à escuridão e ele foi possuído pelo Heartless deXehanort (que era então chamado de Ansem), o verdadeiro vilão do jogo. Sora e os seus amigos conseguem derrotar Xehanort. Enquanto Sora investiga a entrada para a escuridão, Riku e o rei Mickey aparecem do outro lado da porta e juntos fecham-na dos dois lados: com a Keyblade do Sora no domínio da luz e a Keyblade de Mickey no domínio da escuridão.
À medida que os mundos se restauram, Kairi e Sora são separados. Sora promete voltar para ela assim que ele encontrar Riku e a entrada para a luz.

Kairi è uma garota que vive nas Destiny Islands, lá, è a melhor amiga de Sora e Riku.sora que pergunta para ela se Kairi tem saudades de sua terra natal, Kairi responde que não, e que è feliz nas Destiny Islands, mas mesmo assim, Sora planeja fazer um barco para ele, Kairi e Riku irem procurar pela terra natal de Kairi, um dia antes da embarcação, a Destiny Islands foi atacada pelos Shadows e por Darkside, quando Sora encontra Kairi, ela è empurrada pelo vento que sai da porta dentro de uma caverna em Destiny Islands, Kairi atravessa Sora e desaparece, ficando perdida na escuridão. Depois disso, Sora vê varias ilusões da Kairi em alguns mundos (como em Traverse Town e Deep Jungle), atè que em Neverland, Sora encontra Kairi, que não se move, pois não tem mais seu coração (que Sora guardou dentro dele quando Kairi o atravessou durante a destruição das Destiny Islands), depois disso, Sora a encontra em Hollow Bastion, depois que Sora descobre que o coração de Kairi estava dentro dele, ele usa a Keyblade obscura para arrancar seu coração e o de Kairi, depois de virar um Heartless e voltar ao normal, ele se separa de Kairi de novo, no final do game, Sora e Kairi são separados novamente e Kairi vai parar na Destiny Islands, Sora promete encontra-la assim que achar o Rei Mickey e Riku.

Riku planeava viajar pelo mar com Sora e Kairi para ver o que havia além da Destiny Island. Porém na noite anterior a viagem a ilha é atacada por Heartless. Enquanto Sora luta contra eles, encontra Riku, que é levado pelas trevas e desaparece assim como Kairi. Logo em seguida Sora reaparece na cidade de Traverse Town.
Riku acorda em Hollow Bastion, encontrando Maleficent, que se aproveita da curiosidade e da fraqueza do coração de Riku para manipulá-lo e trazê-lo para as trevas. Ao ver Sora comDonald e Pateta, Riku acredita que seu amigo o abandonou e cada vez mais tem seu coração consumido pela escuridão.
Chega um momento que Riku perde seu coração para Ansem, um homem misterioso que estudava sobre os corações e osHeartless. Ansem toma o corpo de Riku como hospedeiro para concluir seu plano de conquistar Kingdom Hearts, já que seu antigo corpo já não existia mais porque foi consumido totalmente pelas trevas.
Enquanto Sora é escolhido pela Kingdom Keyblade, capaz de fechar as portas dos mundos e os corações das pessoas em seus corpos, Riku acaba ficando com outra Keyblade, capaz de abrir as portas dos mundos e liberar os corações dos corpos das pessoas. Mais tarde essa keyblade se transforma na Way to the Dawn, a Keyblade oficial de Riku em Kingdom Hearts 2. Quando Sora chega em Hollow Bastion, encontra Riku controlado por Ansem e trava uma terrível batalha contra o amigo. Derrotado, Riku se transforma em Ansem e entra no portal de Hollow Bastion para Kingdom Hearts. Sora fica, e usa a keyblade de Riku para tirar o coração de Kairi de seu corpo.
Após a batalha final entre Sora e Ansem, Sora tenta fechar as portas de Kingdom Hearts, mas não consegue. De repente, Riku aparece de dentro de Kingdom Hearts e, junto do ReiMickey, ajuda Sora, Donald e Pateta a fechar as portas por dentro, ficando os dois trancados dentro.

Donald é o teimoso, obstinado Court Mage da Disney Castle, um amigo próximo ao monarca do mundo, o Rei Mickey. Ele se especializou na arte de ambos magia branca e negra, com sua equipe de confiança. As coisas estão de cabeça para baixo em sua terra natal, quando ele encontra uma carta de seu rei ausente, dizendo-lhe para viajar com o Capitão Pateta para o mundo exterior e buscar o portador da chave.

Pateta é o alegre, desajeitado, Capitão da Royal Knights of Disney Castle. Ele despreza a luta, com um tipo muito simpático de alegria sobre ele, e só usa armas para se defender e os outros. Ele é considerado um dos mais fiéis amigos alguém poderia pedir. Ele é um amigo íntimo do rei, e segue suas ordens para viajar com Donald para Traverse Town, em busca de "um homem chamado Leon" e portador da misteriosa Keyblade.

Embora raramente visto no jogo, Pateta, Donald e todos os habitantes da Disney Castle mostram grande respeito e fé nele. Ele saiu antes ilha de Sora foi destruída para encontrar a razão pela qual as estrelas iria sair um por um. Seu paradeiro exato é desconhecido para a maior parte da jornada de Sora, mas ele mostrou-se apenas no momento em Kingdom Hearts para ajudar Sora. Juntos, os dois selaram a porta com a Keyblade.

A garota de nome Naminé, personagem introduzida em Kingdom Hearts: Chain of Memories,tem como habilidade especial a manipulação psiquica por meio da memória, sendo que ela pode alterar as lembranças de uma pessoa, apagá-las temporaria ou definitivamente, e introduzir novas, reais ou fictícias. Naminé também consegue "desenhar perfeitamente" e seus desenhos acabam se "tornando reais".
Sua história tem ínicio em Kingdom Hearts(o primeiro jogo da série), quando criada pelo amor de Sora e Kairi. Esta tem sua primeira aparição em Kingdom Hearts: Chain of Memories. No contexto, ela é capturada pela Organization XIII, a qual revela interesses evidentes em sua capacidade especial e única, para realizar seus objetivos de obter Kingdom Hearts.
Tendo o poder de manipular memórias de pessoas relacionadas ao Sora, a Organization XIII obriga-a a usar seus poderes para manipular e alterar as memórias de Sora e seus amigos que estão nos castelo. Ao longo de todo o jogo, ela faz com que eles percam suas antigas memórias, restando-os apenas as memórias do que viveram no castelo, e os guia de acordo com os planos dos integrantes da Org. XIII que estão presentes no castelo. Durante a aventura, todos os cenários vividos em Kingdom Hearts são novamente visitados, visto que os locais no castelo são construídos com base nas memórias de Sora e seus amigos.
No fim de Kingdom Hearts : Chain of Memories (Sora's Mode), ela encontra-se com Sora, quem promete que irá resgatá-la. Naminé o coloca para dormir em uma câmara oval, onde ele recuperaria suas memórias, mas se esquece de tudo o que havia ocorrido no castelo. Para que Sora, Donald, Goofy lembrassem de retornar ao castelo, Jiminy Cricket anotou em seu "Journal": "Thank Naminé" ou "Agradeçam Naminé". Riku também conhece Naminé em Kingdom Hearts : Chain of Memories (Reverse/Rebirth), ao passar por uma das portas de Twilight Town, e chegar na sala da câmara onde Naminé havia colocado Sora para recuperar as memórias.